Dato che sei alla ricerca di motivi della lentezza, e quindi stai facendo un po' di test per arrivare ad una diagnosi, ti suggerisco di installare mysql e il tuo db sullo stesso pc del server web e accedervi tramite named pipes. Se vi è un forte incremento nelle prestazioni il problema potrebbe essere dovuto anche a sovraccarichi di rete... le prestazioni di un server sql, che se ne dica tramite la rete sono sempre peggiori che in locale (come dicono anche sul manuale).
Sempre riguardo alla rete non vorrei che vi fosse uno scambio di troppi dati tra server sql e driver odbc, oppure che andassero a singhiozzo. Dai un occhiata alle spie delle schede di rete per vedere se c'e' qualche comportamento strano, tipo un recordset di 100 record che passa a singhizzo in rete perchè magari i cursori utilizzati non sono i piu adatti, ecc.

Ciao!
Paolo