ciao,
beh la risposta te l'ha già suggerita il server!!
basta che forzi il sistema ad aumentare il tempo limite per l'esecuzione di uno script, usando l'oggetto Server.ScriptTimeOut().
c'è da dire che questo può non funzionare, cioè l'amministratore del sistema può aver deciso che il limite non può essere aumentato.
ciò che dici comunque è abbastanza strano, perchè di solito il tempo di default impostato per gli script è sufficiente a far eseguire anche quelli più pesanti....forse è solo che ogni tanto il server si blocca...

...vina bibant homines, animalia cetera fontes...