Ciao webbondo,
Devi creare più Azure Function App? o solamente 2 function?
Nel secondo caso, basta aggiungere la funzione al progetto.

Nel primo caso, se devi condividere del codice e le function app devono essere deployabili in tempi diversi, potresti prevedere l'utilizzo di pacchetti Nuget per il codice in comune.
Se invece le function app hanno lo stesso ciclo di vita, potresti referenziare il progetto nella stessa solution delle function app.
Dipende dallo scenario di utilizzo delle function app.

In fase di pubblicazione è possibile pubblicare le function app che stanno sulla stessa soluzione perchè sono effettivamente progetti diversi (DLL).