Ciao,
sì, il tool è stato rimosso da Visual Studio 2013 ma poteva essere riabilitato seguendo queste istruzioni.
http://blogs.msdn.com/b/webdev/archive/2013/08/19/asp-net-web-configuration-tool-missing-in-visual-studio-2013.aspx
Non saprei dire se funzionano anche con Visual Studio 2015 perché personalmente non ho mai provato a riabilitarlo.

Il fatto è che sta cadendo in disuso perché Microsoft per i nuovi progetti suggerisce di adottare la nuova API per la gestione di utenti e ruoli, che si chiama ASP.NET Identity.

Nel tuo progetto stai usando ASP.NET Identity oppure le vecchie Membership e Roles API?

Nel primo caso puoi aggiungere un pannello di gestione di utenti e ruoli procurandoti un pacchetto da NuGet che si chiama IdentityManager.
Lo trovi descritto in questo articolo.
http://www.aspitalia.com/script/1185/Amministrare-Utenti-Ruoli-ASP.NET-Identity.aspx
Dalla pubblicazione dell'articolo il nome del pacchetto è cambiato, quindi il comando per installarlo è questo.

Se hai bisogno di documentazione la trovi nella sua wiki su GitHub.
https://github.com/IdentityManager/IdentityManager/wiki

Vedo che hanno pubblicato anche un progetto che fa riferimento a Membership API, ma non l'ho mai provato. Se stai usando Membership vedi di che si tratta.
https://github.com/IdentityManager/IdentityManager.MembershipReboot/tree/master/source

ciao,
Moreno

Ciao,
non so cosa potrebbe essere. Le istruzioni sono state postate sul blog di MSDN quindi immagino che siano corrette.
Verifica che 8080 e 8082 non siano porte già usate per altri siti web in IIS. Poi assicurati anche di aver inserito correttamente il percorso della tua applicazione quando arrivi a questo passaggio.

In the URL enter the following “http://localhost:8082/asp.netwebadminfiles/default.aspx?applicationPhysicalPath=[appPath]&applicationUrl=/” substituting the [appPath] with the absolute path to the Visual Studio Project folder with the solution file in it.

La cartella deve essere quella che contiene il file .sln e, dato che è un valore che stiamo passando via querystring, dovrebbe essere passato all'url encoding.
Esempio: C:\inetpub\myapp diventa:

Lo puoi convertire usando questo tool.
http://meyerweb.com/eric/tools/dencoder/

ciao,
Moreno