ciao, benvenuto nel forum, piacere di leggerti.

Per il ClickOnce, le modalità di deploy sono limitate ad una cartella locale o ad una cartella remota raggiungibile via FTP.
Il "pacchetto web" in questo caso non è disponibile perché non è prevista nel server la presenza di un servizio come IIS in grado di "spacchettarlo".
Il server infatti deve limitarsi ad ospitare i file ottenuti dalla pubblicazione da Visual Studio.

ctex ha scritto:

usando FTP mi chiede la password ogni volta, non c'è un modo per memorizzare la password?

Prova a passare username e password nell'url ftp://, come vedi in questa risposta.
http://stackoverflow.com/questions/1308541/in-vs2008-for-ftp-publishing-of-a-website-is-there-a-way-to-save-ftp-logon-pas

ciao,
Moreno