Manca qualcosa in quello che chiedi... intanto essendo una relazione molti a molti esiste una tabella intermedia che associa app e usr?
Per come è posta la tua domanda sono sufficienti delle select... oppure inendi che dato uno user vuoi le app corrispondenti e viceversa data una app vuoi gli user corrispondenti?

La query SQL che risolve il mio quesito è:

SELECT A.app, A.rol, B.usr
FROM A INNER JOIN
B ON A.rol = B.rol
WHERE (A.app = 'a1') AND (B.usr = 'u1')

ora vorrei trasformamrla in query linq magari usando gli extension method.

qualche aiuto?
grazie