si' che si puo' fare.

basta che tu sull'evento onClick dell'elemento
presente nella popup metta l'assegnazione del suo valore
al campo del form della finestra principale:

onClick="window.opener.document.form1.testo.value=this.value"

opener e' la finestra principale da cui hai fatto aprire
la popup.

ad esempio, metti che nella popup tu abbia un form tipo:

<form name="form2">
<input type="checkbox" value="selezionato" onClick="window.opener.document.form1.testo.value=this.value"> seleziona questo checkbox
</form>

selezionando quel checkbox il suo valore viene scritto
nel campo testo del form della finestra opener.

ciao ciao