Ciao

Con VS .net puoi sviluppare per pda già dalla versione standard, compreso nel pacchetto è presente un simulatore per pda con il sistema operativo a scelta che dovresti montare sul vero pda; poi se colleghi il pda al pc il framework non esegue il suo simulatore ma si accorge che è collegato un vero palmare al pc e passa tutto lassù e lo puoi gestire dal pc.
Se cerchi su google o anche su microsoft ovviamente per adesso credo che ci siano articoli solo in inglese, trovi un fiume di roba.
per sincronizzare tutto o lo fai con activesync oppure dovresti sviluppare qualcosa tu con le librerie di activesync, scegli.

Ciao buona domenica