A mio parere mantenere uno storico su tabelle diverse o db diversi può avere pregi e difetti a seconda dei risultati che vuoi ottenere e al tipo di db che usi.

Se devi fare calcoli che di frequente coinvolgono lo storico è un difetto.

Un difetto può essere anche il fatto che devi sviluppare più codice rispetto alla tecnica vi mettere un semplice flag e di filtrare le query.

Il pregio è senz'altro quello di snellire le tabelle dei dati correnti. Ma questo 'snellimento' è strettamente legato al tipo di db che usi e alla quantità dei dati. Ad esempio se usi Access ed elimini continuamente record aggiungendoli ad un'altra tabella duplichi lo spazio occupato fino a che non farai una compattazione del db.
In un altro caso se hai un db più efficente e i dati non sono tantissimi lo 'snellimento' sarà irrilevante.

Spero di esserti stata utile. Ciao.