Ciao,

la domanda è lecita ma sbagliata a livello architetturale;
cioè per utilizzare un software che utilizza diverse fonti dati, non è nel tableadapter che risiede la soluzione .

Se parliamo, a grandi linee, di un software strutturato nei classici tre livelli ( presentazione, business, data ), si tratta solamente di struttura il livello Data, in modo che posso essere cambiato in funzione del database in uso.

Lo puoi fare, grazie alle interfacce ; a livello di business effettui delle chiamate a dei metodi che verranno poi implementati dallo strato software che verrà caricato a runtime.