salve,
grazie per aver indicato il problema e la soluzione...
in effetti, SQL Server effettua le chiamate su linked server tramite il protocollo OLE DB, ed in SQL Server questo protocollo determina i metadati impostando SET FMTONLY ON in modo da ottenere tutte le informazioni necessarie per la creazione del result set, ma questo comporta che il comando viene "eseguito" (anche se non effettivamente eseguito, ma valutato) nella sua interezza, passando per tutti i nodi condizionali a prescindere dal loro effettivo valore..

se brutalmente provi ad eseguire con SSMS e risultato in "formato testo"
SET NOCOUNT ON;
GO
SELECT 'inizio';
IF (1 = 1) BEGIN
PRINT 'questo e'' vero';
SELECT 'questo e'' vero';
END;
ELSE IF (1 = 2) BEGIN
PRINT 'questo e'' falso';
SELECT 'questo e'' falso';
END;
GO
SET FMTONLY ON;
SELECT 'inizio';
IF (1 = 1) BEGIN
PRINT 'questo e'' vero';
SELECT 'questo e'' vero';
END;
ELSE IF (1 = 2) BEGIN
PRINT 'questo e'' falso';
SELECT 'questo e'' falso';
END;
GO
SET FMTONLY OFF;

potrai constatare che, anche se non viene in effetti eseguito il comando nel caso di FMTONLY ON, tutte e 2 le branches del codice vengono "valutate" ed in effetti avrai 2 righe di "-------" oltre all'iniziale relativo al comando SELECT 'inizio';

Erland Sommarskog ha gia' in passato affrontato l'argomento in
http://www.sommarskog.se/share_data.html#OPENQUERY

saluti