Ti dico solo come faccio io.
1)non uso Ajax.net (UpdatePanel) se non in casi realmente necessari.
2)Nel ListView metto una colonna con un checkbox per riga per selezionare gli elementi da cancellare.
3)una volta che l'utente seleziona le righe (i checkbox) da cancellare, un pulsante, o link, fa partire la procedura lato server.
4) i check box sono di tipo html con name sempre identico ma value=id che voglio cancellare

<input name="check_delete" id="check_delete_<%#Eval("id")%>" type="checkbox" value="<%#Eval("id")%>" />

La procedura che si occupa della cancellazione non fa altro che recuperare la variabile form ricevuta che sarà una cosa del genere:

Dim keys As String = l.RequestParams("check_delete")

Keys contiene gli id da cancellare separati da , tipo "4,8,99,...,147"

e finalmente la query di cancellazione, semplice semplice

Sql = String.Format("DELETE FROM [tabella] WHERE [ID] in ({0}) ", keys)


alla fine aggiorno il ListView col comando

Me.BindData()

ps. nota che è più facile implementarlo che spiegarlo bene!

Cosi però li recupera tutti anche quelli non flaggati giusto ?

No! sbagliato.

Qui comanda sempre il semplice html.
Un elemento <input type="checkbox" /> viene trasmesso al server solo se ha un name (non id) e se è selezionato. Se più checkbox hanno lo stesso name e diverso value, viene trasmessa al server una stringa name di valore valore1,valore2,valore3.......

del resto, è meglio che non ti fidi. Fatti una pagina html. Mettici dentro alcuni checkbox con lo stesso name e value diversi, dentro un form. Mettici un pulsante di submit e fai in modo che l'action del form sia una pagina aspx.
Nella pagina aspx recuperi quello che è stato spedito. Così fai la verifica e ti togli ogni dubbio.

ciao