mah, sembra solo che ti dicano che i contenuti che non avrai ancora migrato sul nuovo sito, devono comunque essere raggiungibili, es. tramite link, fino a che non avrai migrato tutto

come dice teo, secondo me devi puntare al vecchio, poi credo che meglio di te non c'è nessuno che possa capire quanto sia complicato integrare i due sistemi. Generalmente, quando mi capitano queste situazioni, se il vecchio è tutto da buttare non sto a perderci troppo tempo e faccio in modo che il cliente lo utilizzi per il tempo necessario a presentargli qualcosa di nuovo. In questo intervallo di tempo si cerca di far usare il vecchio sistema in parallelo (spesso è difficile o ci vuole più tempo a realizzare un'interfaccia che si integri con il vecchio piuttosto che rifarlo da zero per la nuova applicazione). Qui comunque sta a te e alla tua abilità di portare il cliente dove vuoi tu senza ovviamente creargli troppi disagi (spesso il cliente non sa bene cosa vuole e correr dietro ad ogni sua affermazione rischia di crearti più casini che altro)
ciao

chiaro sei stato chiaro

ti fai un menù nel nuovo che comprende anche link a tutte le pagine non aggiornate del vecchio

se era un cms i link dovresti averli nel db, quindi la cosa non dovrebbe essere troppo pesante

così l'indicizzazione delle pagine non migrate le perdi solo mano a mano che aggiorni

non so se è possibile gestire la cosa diversamente...ma al volo mi viene in mente di poter gestire la cosa tramite frame e url rewriting...in questo modo il percorso che appare è sempre lo stesso, ma il tuo sistema gestisce la redirezione da una parte e dall'altra.
La butto lì così, ma prendila come spunto e valuta se può essere integrata facilmente.
ciao