Puoi utilizzare Dotfuscator CE.

Ricordo che una volta mi sono preoccupato di questo problema e ho visto che esistevano dei prodotti in commercio per l'offuscamento, che in pratica si installavano sul computer del cliente come un motore aggiuntivo.

In pratica il codice veniva cifrato e non c'era modo di usare il reflector. Quando il codice veniva eseguito, veniva decifrato in memoria e avviato tramite questo prodotto.

Erano prodotti a pagamento e ne esistevano più di uno, però parliamo del periodo di Visual Studio 2005, quindi acqua sotto i ponti ne è passata.

D'altro canto qualche annno dopo mi sono capitati clienti che avevano prodotti senza codice e mi avevano chiesto di valutare un decompiling completo delle librerie (di loro proprietà a tutti gli effetti).

La valutazione era disastrosa, anche volendo farlo, con il reflector ci volevano giorni e poi bisognava capire che cavolo facevano le classi, si perchè una volta che hai il codice con classi che si chiamano Class1, Class2 o Interface1, prima di capire a che servono e come si comportano...
Da allora non mi sono mai più preoccupato di offuscare in qualche modo il codice :-)