Se la pagina va in Timeout il problema rimane e la soluzione non è di certo il reload applicativo.

Potresti magari far eseguire il codice in un thread asincrono e visualizzare un messaggio di attesa qualora il processo non sia ancora terminato.

Chiaramente parto dal presupposto che il codice "costoso" in termini di tempo sia eseguito una sola volta visto che dici che al secondo reload il problema non si ripresenta.

Marco

JFYI: se, nonostante il timout della connection sia elevato, riscontri ancora degli errori di timeout expiration devi aumentare anche quello del command.
HTH