Gli utenti per accedere a SQL Server devono, ovviamente, essere autorizzati a farlo. Puoi semplificare la gestione dei permessi definendo preventivamente in AD dei gruppi (uno o più a seconda delle differenti tipologie di utenti che andrai a censire) e dando l'accesso ai gruppi e non ai singoli utenti.
Anche la gestione dei permessi sugli oggetti di database seguirà quindi la mappatura gruppo -> oggetto.
Per discriminare per ciascun utente "i suoi dati" dipende da quello che intendi. Se ciascun utente o gruppo di utenti accede a diversi oggetti non devi far altro che assegnare i permessi sugli oggetti di competenza di ciascun gruppo. Se invece nell'ambito della stessa tabella (ad esempio) ci sono dati di tizio e dati di caio che solo i legittimi proprietari devono poter visualizzare allora la cosa si complica ed hai bisogno di implementare una sorta di "row level security". Uno dei modi per farlo è quello di avere un campo della tabella che discrimina l'owner. Creando una vista definita come

CREATE VIEW dbo.MyView
AS

SELECT campi
FROM dbo.MyTable
WHERE RecordOf = SYSTEM_USER

In questo modo chiunque accede alla vista vedrà solo ed esclusivamente i record di cui è l'owner.

Bye

Se valorizzi quella colonna con un GUID ti serve comunque un metodo per mappare quel valore con l'utente. Fai prima a memorizzare l'utente con la funzione che ti ho citato (o altra similare).

Bye