Ah ho capito!
Questi sono quei classici problemi.. per cui ti viene da dire.. adesso perchè fa così??

Hai provato a rieffettuare di nuovo un replace?
Io credo che sia più che naturale che in fase di modifica li visualizzi!
Questo perchè in fase di creazione hai fatto il replace.. e quindi nel db va a finirci anche il tag <br/>(ed è giusto che così sia).
quindi magari tu hai scritto:
Lui nel db memorizza Ciao<br/>come va?
Ovviamente quando recuperi i dati dal db.. se li butti direttamente in una textbox.. io credo che sia più che normale che ti veda anche i <br/>, perchè la textbox non interpreta l'html, perdonatemi tutti se sto dicendo una stupidata

a quest'ora sarà normale.
Se è vero quello che dico.. potresti a questo punto.. recuperare i dati dal db.. e salvarli in una label(dove effettui un opportuno replace, per eliminarli) e poi copi il contenuto della label all'interno della textbox
