Questo l'hai letto?
http://www.aspitalia.com/articoli/windows-azure/applicazioni-web-on-the-cloud.aspxIn particolare ti potrebbe essere utile il paragrafo "Considerazioni sullo sviluppo di applicazioni per Windows Azure" (pagina 5).
La risposta alla tua domanda tendenzialmente è "no, è impossible" poiché un'applicazione non pensata per Azure difficilmente potrà esssere eseguita correttamente on-the-cloud; i motivi sono tanti: dal banale esempio di accesso al file di configurazione mostrato nell'articolo, all'uso del file system, all'accesso al database.
Puoi però verificare tu stesso quante e quali porzioni di codice dovrai modificare utilizzando l'SDK di emulazione di Azure.
HTH