Allora cerchiamo prima di capirci. Un conto è il workflow, un conto è il db e un conto è la persistenza del workflow. Le opzioni quindi sono
1 - puoi far raggiungere il workflow attraverso un servizio pur mantenendo tutto il resto così com'è
2 - puoi cambiare il motore di persistenza del workflow e non farlo andare direttamente su db ma farlo passare da un webservice
3 - l'applicazione web invece di andare direttamente sul db (diverso da quello di persistenza, sono due cose diverse) e farlo passare da un web service che fa da tramite. In questo caso comunque il workflow non c'entra, si tratta di dati che usi per la parte web
4 - il workflow accede al database (non quello di persistenza) condiviso anche con l'applicazione web perciò puoi migrare l'accesso ai dati sia parte del workflow sia da parte dell'applicazione web attraverso un web service che fa da tramite sui dati
Quale di queste vuoi fare?