Puoi per esempio nel web config inserire le tue stringhe di connessione:

<appSettings>
 <add key="connStr" value="Provider=SQLOLEDB;Data Source=.\SQLEXPRESS;Integrated Security=SSPI;Initial Catalog=Nome1"/>
    <add key="connStr2" value="Provider=SQLOLEDB;Data Source=.\SQLEXPRESS;Integrated Security=SSPI;Initial Catalog=Nome2"/>

</appSettings>

Poi puoi selezionarli in questo modo in una dropdownlist (drpconn):

 //Prelevo i valori dal file webconfig
foreach (var s in System.Configuration.ConfigurationSettings.AppSettings.AllKeys)
 {

 drpconn.Items.Add(new ListItem(s.ToString(), System.Configuration.ConfigurationSettings.AppSettings[s]));

}

Ciao Marco

        ConnectionStringSettings sett = new ConnectionStringSettings();
        sett.ConnectionString = "... bla bla bla "; 
        sett.Name ="connstr_dinamica";
        System.Configuration.ConfigurationManager.ConnectionStrings.Add(sett);