Ciao,
è poco probabile che trovi qualcosa di managed, ma più probabile che tu abbia librerie com della quale fare interop.
Per gli mp3 una libreria famosa è http://lame.sourceforge.net/

Per modificare volume e quant'altro, la cosa più difficile. Se per esempio usi directshow ti puoi permettere di aprire e lavorare qualsiasi formato audio compatibile con quella libreria (praticamente tutti).
Puoi partire da questa libreria .NET che fa l'interop di alcune classi
http://directshownet.sourceforge.net/
che contiene tanti filtri per aprire, modificare e reincodare audio e video. Per alzare il volume non credo ne esista già uno. Dovresti guardare in giro. Dal punto di vista tecnico si tratta di fare una FFT e alzare tutti i livelli.